Kupnjom riba postavlja se pitanje kako ispravno mijenjati vodu u akvariju. Mi smo prisiljeni raditi ovaj posao kako bi sačuvali biobalans u spremniku. Uostalom, dio otpadnih proizvoda naliježe na dno, a dio se otapa u vodi i zagađuje. Potpuna zamjena vode ili njegova djelomična zamjena ˗ vrsta je čišćenja staništa ribe.
Zamjena podrazumijeva tjednu zamjenu treće, četvrte ili petine svježe vode, po mogućnosti podmirene. Da riba ne dobije šok, preporučljivo je ne dopustiti veliki pad temperature, što može negativno utjecati na zdravlje i ponašanje stanovnika. Neki akvaristi mijenjaju vodu u malim dijelovima, izlijevaju je izravno iz slavine. Najčešće je ova metoda prakticiraju vlasnici velikih akvarija, prilagođavajući se kućnim ljubimcima i imaju normalnu učinkovitost tekućine.
Postupak je izuzetno nepoželjan, jer je spremnik ponovno pokrenut. Primjenjuje se u posebnim slučajevima širenja bakterijske ili gljivične infekcije. Ako imate puno ribe, potreban vam je rezervni akvarij ili neki drugi sprinkler. Biljke se, u pravilu, izvlače bacanjem bolesnika. Akvarij se čisti s posebnim sredstvima, dezinficirati i osušiti. Stanovnici započinju tek nakon normalizacije kemijskih i bioloških pokazatelja, najčešće ne prije tjedan dana.