Njemački ovčar je jaka i jaka životinja. Međutim, kao i sve ostale pasmine pasa, ovaj pastir je osjetljiv na različite bolesti. Najčešći kod ovih životinja su poremećaji probavnog trakta, oka, uha i poremećaja mišićno-koštanog sustava.
U bolesnom psu vuna je dosadna, opuštena općenita pojava, depresivno stanje. Pas stalno leži, ne odgovara na poziv vlasnika.
Ako vaš njemački ovčar često ima trbušni poremećaj, tada biste trebali odabrati kvalitetnu hranu za kućne ljubimce i nemojte ga preopteretiti. Uz nepravilno hranjenje, prisutnost crva, neke zarazne bolesti u psu mogu uzrokovati gastritis. S produljenim abnormalnim djelovanjem trbuha, rad crijeva također je poremećen.
Bolesti kože u psu mogu biti uzrokovane bakterijama, gljivicama i parazitima.
Pojava svrbeža u njemačkom ovčaru u odsustvu buha može biti simptom takvih kožnih bolesti kao i pioderme , pododermatitis, seborrhea, furunculosis. Ponekad se dermatitis može pojaviti kao popratna bolest na pozadini lezija unutarnjih organa životinje.
Njemački ovčar sklon je takvoj bolesti kao atopična alergija koja se može pojaviti kod štenaca u dobi od jedne godine. Psi imaju svrbež, ogrebotine i čak i mokri ekcem. Često na pozadini takvih alergičnih štenaca pate od proljeva.
Mladi njemački ovčari ponekad pate od poraza humerusa, popraćeni slabom ili čak teškom hromošću. Drugi ozbiljan problem njemačkih pastira - paraliza stražnjih nogu, što se često događa kod šest ili sedam godina starih mužjaka. Prvo, pas ne želi skočiti preko prepreka, teško joj je hodati po stubama. Kada bolest napreduje, rep je pogođen, a zatim počinju stražnji udovi, inkontinencija mokraće i izmet. Ako je bolest neizlječiva, tada se životinja eutanazizira.
S dobi, njemački ovčar može imati problema s kardiovaskularnim sustavom, tako da psi tijekom sedam godina za prevenciju trebaju redovito posjećivati veterinara.